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医师变更注册的网上申请操作步骤如下。
1、登录医师电子化注册系统（网址：https：//www.cndocsys.cn/home/index），初次使用者需先进行注册，注册后登录系统。
2、在系统登录后，点击“个人端入口”，进入医师电子化注册系统，在医师注册账户页面输入姓名和身份证号进行账户验证，验证通过后，进入个人账户设置页面完善个人信息。
3、在个人账户设置页面填写姓名、性别、证件类型、证件编码等个人信息，并上传证件照片，填写完成后点击提交保存，提交保存后，等待医师资格信息校验，校验通过后，点击业务办理，选择变更注册，填写变更注册信息，选择变更后的执业地点并提交，填写完成后等待医疗机构确认申请信息并打印申请表。
4、医疗机构确认申请信息无误后打印申请表并签字盖章，医疗机构在规定时间内将纸质材料和申请表一并提交到注册卫生行政部门进行审批，审批通过后，变更注册成功。
步骤完成后即可完成医师变更注册的网上申请操作，请注意确保提交的信息准确无误，如有疑问请及时咨询相关部门或机构。